Mẫu kháng nguyên được chia thành gạc mũi họng, gạc hầu họng và gạc mũi. Người vận hành chọn và thu thập chúng theo các yêu cầu của hướng dẫn thuốc thử.
So với các gạc mũi họng và hầu họng thường được thu thập để phát hiện axit nucleic, gạc mũi được thêm vào các mẫu kháng nguyên. Phương pháp thu thập cụ thể là người được thu gom trước tiên dùng giấy vệ sinh xì mũi, sau đó hơi nghiêng đầu. Người lấy mẫu nhẹ nhàng giữ đầu người cần thu bằng một tay, dùng tay kia chọc tăm bông vào một bên lỗ mũi, từ từ thâm nhập vào 1-1. Lùi lại 5cm dọc theo đáy của đường mũi dưới, và sau đó xoay hốc mũi ít nhất 4 lượt (thời gian lưu không dưới 15 giây), rồi dùng tăm bông đó lặp lại thao tác tương tự ở hốc mũi còn lại. Sau khi lấy từ từ tăm bông ra, nhúng đầu tăm bông vào hộp lấy mẫu có chứa dung dịch bảo quản phù hợp với que thử.
Đây cũng là cách cư dân tự kiểm tra. Những người 2-14 tuổi phải được lấy mẫu bởi những người lớn khác; Những người trên 14 tuổi có thể tự lấy mẫu ngoáy mũi.